262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12390 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  44.93 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  44.28 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  39.27 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  41.32 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  37.73 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  42.33 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  40.25 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  35.05 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  36.98 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  40.12 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  39.26 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  41.46 
 
 		 205 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  35.48 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  39.63 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  32.97 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  35.9 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  38.36 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  39.51 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  38.36 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  34.25 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  36.48 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  36.36 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  31.28 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.15 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.91 
 
 		 480 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  32.78 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  36.14 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  32.22 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  39.63 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.22 
 
 		 554 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  40.24 
 
 		 205 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  39.38 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  30.17 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  30.64 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.64 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  37.72 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.28 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  30.7 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.95 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.46 
 
 		 480 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.13 
 
 		 528 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  38.41 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  30.9 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  29.17 
 
 		 468 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  32.95 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.15 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.18 
 
 		 476 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  35.58 
 
 		 465 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.73 
 
 		 626 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  34.27 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.39 
 
 		 481 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  35.54 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.82 
 
 		 478 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  32.83 
 
 		 476 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.99 
 
 		 464 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  31.71 
 
 		 465 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  29.61 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  36.48 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.26 
 
 		 800 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  33.73 
 
 		 188 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  29.63 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  31.74 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  37.74 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  31.14 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  31.14 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  28.97 
 
 		 151 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  31.46 
 
 		 182 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  31.28 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.12 
 
 		 472 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.88 
 
 		 479 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  26.14 
 
 		 314 aa  92.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  32.89 
 
 		 198 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  30.64 
 
 		 303 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  31.93 
 
 		 195 aa  91.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.46 
 
 		 502 aa  91.7  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  30.64 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.44 
 
 		 473 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  30.64 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.98 
 
 		 473 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  28.04 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  30.06 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  33.79 
 
 		 464 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.44 
 
 		 489 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  31.46 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  27.13 
 
 		 462 aa  89.4  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.25 
 
 		 482 aa  89.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1508  siroheme synthase  27.23 
 
 		 228 aa  89.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.359282  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.97 
 
 		 462 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.3 
 
 		 470 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  32.53 
 
 		 303 aa  88.6  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  33.33 
 
 		 155 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  32.85 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.95 
 
 		 482 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.75 
 
 		 837 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>