123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12240 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12240  transcriptional regulator  100 
 
 		 396 aa  791    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000172976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1106  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.03 
 
 		 497 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0413788  hitchhiker  0.0000000000000467776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15160  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.44 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.481311  normal  0.251457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.55 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.53 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.89 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.64 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  27.27 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.33 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.76 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.16 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.93 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2449  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.05 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00377769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  21.43 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.06 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.09 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.41 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.61 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.24 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.91 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.72 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.17 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.17 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.21 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.33 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.81 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.94 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.45 
 
 		 521 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.16 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.88 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  23 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.5 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.88 
 
 		 618 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.28 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.28 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.86 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.64 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35.79 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.85 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.91 
 
 		 490 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.44 
 
 		 488 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.2 
 
 		 509 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1433  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.19 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  25.52 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.19 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.62 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.36 
 
 		 547 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  23.88 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.41 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1145  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.25 
 
 		 543 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.68 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.78 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.06 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  26.47 
 
 		 497 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  25 
 
 		 336 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.3 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.43 
 
 		 320 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.76 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.57 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.65 
 
 		 345 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  30.48 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 		 584 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.38 
 
 		 374 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  29.84 
 
 		 345 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9275  Transcriptional regulator-like protein  25.26 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  30.65 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  29.84 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  27.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  29.84 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  23.35 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  29.84 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  27.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.67 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  30.65 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  30.65 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  29.84 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  27.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  23.08 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  26.79 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  26.79 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.54 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  29.91 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.12 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.84 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0535  hypothetical protein  31.96 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.05 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  22.98 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.75 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>