More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  58.05 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  52.49 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  37.31 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  38.4 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  36.1 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  39.42 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  39.42 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  37.05 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  36.21 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  37.05 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  35.65 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  35.65 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  37.21 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  34.67 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  35.22 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  38.93 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  36.93 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  36.02 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.87 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  37.7 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  32.55 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  34.17 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  35.54 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  36.44 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  33.91 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  36.25 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  36.73 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  38.24 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  32.82 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  37.89 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.71 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.85 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  28.81 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  36.04 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  30.8 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.54 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  29.46 
 
 		 364 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  34.73 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  30.53 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.05 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  37.83 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  35.07 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  32.93 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  30.96 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  35.96 
 
 		 400 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.1 
 
 		 339 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  31.03 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  35.91 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  31.74 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  31.22 
 
 		 339 aa  99  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  32.94 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  34.96 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.75 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  29.25 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  31.79 
 
 		 345 aa  96.3  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  32.78 
 
 		 361 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  31.55 
 
 		 194 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  34.43 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  28.85 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  29.66 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.23 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.08 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  30.43 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.48 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  29.54 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  30.89 
 
 		 324 aa  89.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  29.02 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  31.06 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  27.69 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 		 391 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  27.27 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>