76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11950 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  100 
 
 
172 aa  357  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  48.82 
 
 
173 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  48.48 
 
 
447 aa  154  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  46.06 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  46.88 
 
 
157 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  45.56 
 
 
171 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  42.6 
 
 
184 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  40.61 
 
 
160 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  38.75 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  42.01 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  39.39 
 
 
160 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.51 
 
 
185 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  41.82 
 
 
168 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.22 
 
 
194 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.22 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  34.91 
 
 
168 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  41.98 
 
 
176 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  37.95 
 
 
175 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  36.71 
 
 
159 aa  98.6  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  38.24 
 
 
184 aa  97.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  37.65 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.81 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  34.81 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.81 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.18 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.9 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.18 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  34.34 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  37.58 
 
 
185 aa  94.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.28 
 
 
160 aa  94  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  37.35 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  35.4 
 
 
157 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  34.44 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  33.12 
 
 
158 aa  91.3  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  35.62 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  36.08 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  37.42 
 
 
196 aa  88.2  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  37.89 
 
 
188 aa  87.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  34.55 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  33.13 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.87 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  33.54 
 
 
158 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.33 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  33.33 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  34.32 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  32.58 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  34.91 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  35.93 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  31.1 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.26 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.76 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  34.59 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.97 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.8 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  35.19 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.93 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.52 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  27.44 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.97 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.09 
 
 
121 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.53 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  28 
 
 
466 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1394  hypothetical protein  27 
 
 
229 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.138559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>