More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11560 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  78.35 
 
 		 97 aa  160  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  69.07 
 
 		 97 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  71.13 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  40 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  39.58 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  39.13 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  42.39 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  34.78 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>