More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11530 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  100 
 
 
191 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  60.14 
 
 
178 aa  178  3e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  53.06 
 
 
181 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  52.74 
 
 
174 aa  155  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
147 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  41.55 
 
 
149 aa  114  8e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  114  8e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  43.66 
 
 
148 aa  113  1e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40 
 
 
151 aa  111  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  44.76 
 
 
167 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  40.97 
 
 
157 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.96 
 
 
194 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  110  1e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  43.8 
 
 
151 aa  110  1e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.01 
 
 
148 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  110  2e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.23 
 
 
167 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 
151 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.85 
 
 
151 aa  108  4e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
146 aa  108  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  43.36 
 
 
149 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
148 aa  108  7e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  107  8e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  39.01 
 
 
148 aa  107  8e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  45.26 
 
 
151 aa  107  9e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
148 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 
149 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  44.29 
 
 
151 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  38.46 
 
 
148 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
148 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
149 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.65 
 
 
170 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  39.01 
 
 
150 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  105  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  40.52 
 
 
150 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  43.26 
 
 
149 aa  104  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
151 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 
151 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  36.88 
 
 
148 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.72 
 
 
153 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
159 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  35.63 
 
 
172 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.22973e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 
148 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  34.94 
 
 
199 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.72 
 
 
148 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  100  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 
209 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
171 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.56 
 
 
179 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  38.19 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  46 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  46 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.3 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40.56 
 
 
151 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  41.13 
 
 
149 aa  99.4  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  38.78 
 
 
149 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.31 
 
 
147 aa  99.4  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 
150 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 
149 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  98.6  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
149 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 
148 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  41.01 
 
 
148 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 
148 aa  98.2  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 
151 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.3 
 
 
168 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  37.71 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  43.17 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.03383e-05  hitchhiker  1.47927e-09 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  43.17 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  40.54 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  31.03 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.83517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  35.15 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.26689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  35.15 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.27696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 
151 aa  96.3  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.01 
 
 
151 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 
148 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
147 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
148 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  31.03 
 
 
151 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 
150 aa  94.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
147 aa  94.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  41.73 
 
 
148 aa  94.4  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  31.21 
 
 
149 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.09 
 
 
148 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.59 
 
 
148 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  36.17 
 
 
151 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
147 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>