More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11380 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  100 
 
 
480 aa  984    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  54.11 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  34.63 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0374  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.74 
 
 
428 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0054  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
398 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  38.35 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
380 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
356 aa  67  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  43.04 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
389 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
349 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
358 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.41 
 
 
363 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
407 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.4 
 
 
409 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
361 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
860 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  26.4 
 
 
859 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  30.77 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
379 aa  62  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
384 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
389 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0356  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
395 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
385 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  48.15 
 
 
361 aa  60.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
404 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
414 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
368 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
753 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.76 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
375 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
339 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  29.5 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0377  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
392 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778266  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
409 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
502 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  32.3 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
377 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  32.37 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
398 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.1 
 
 
337 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
387 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.1 
 
 
337 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
386 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
363 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 
407 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
391 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  27.12 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
360 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 
404 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
341 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
370 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
430 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
382 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
405 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
439 aa  57  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
1079 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
371 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
404 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>