More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11170 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  70 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 220 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.52 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.48 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>