More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  100 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  91.06 
 
 		 123 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  223  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 124 aa  210  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  207  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  82.64 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  204  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  204  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  81.45 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  80.49 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  199  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  78.69 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 133 aa  196  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  196  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00698  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000175527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2771  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000785263  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  193  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  77.42 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0208  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000137299  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>