More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  65.71 
 
 
692 aa  938  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  65.13 
 
 
692 aa  926  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  63.02 
 
 
704 aa  899  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  59.53 
 
 
693 aa  847  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  63.11 
 
 
691 aa  904  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  58.64 
 
 
723 aa  850  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  62.05 
 
 
700 aa  882  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  62.98 
 
 
701 aa  880  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  62.25 
 
 
700 aa  864  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  62.05 
 
 
700 aa  882  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  63.43 
 
 
701 aa  887  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  62.45 
 
 
703 aa  868  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  61.77 
 
 
700 aa  882  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  61.63 
 
 
700 aa  856  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  62.39 
 
 
700 aa  879  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  62.87 
 
 
703 aa  874  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  62.16 
 
 
704 aa  886  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  63.05 
 
 
704 aa  907  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  62.16 
 
 
704 aa  889  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  61.46 
 
 
698 aa  874  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  5.05947e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  62.34 
 
 
699 aa  875  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  5.27224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  60.81 
 
 
691 aa  866  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  65.85 
 
 
692 aa  941  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  59.19 
 
 
688 aa  849  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.44499e-07  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  62.57 
 
 
699 aa  899  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.61479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  64.95 
 
 
692 aa  929  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  62.62 
 
 
697 aa  906  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  58.72 
 
 
692 aa  843  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  839  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  60.25 
 
 
713 aa  842  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  62.05 
 
 
700 aa  886  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  60.97 
 
 
698 aa  836  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  56.07 
 
 
714 aa  836  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  63.98 
 
 
698 aa  896  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  61.4 
 
 
698 aa  855  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  59.72 
 
 
704 aa  848  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  60.8 
 
 
701 aa  857  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  60.97 
 
 
698 aa  840  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  61.59 
 
 
699 aa  843  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  61.66 
 
 
701 aa  868  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  62.34 
 
 
699 aa  899  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  59.71 
 
 
691 aa  837  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  62.36 
 
 
692 aa  891  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  62.36 
 
 
691 aa  885  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  61.17 
 
 
702 aa  865  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  63.52 
 
 
691 aa  899  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  64.34 
 
 
697 aa  924  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  61.48 
 
 
698 aa  881  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  61.59 
 
 
701 aa  860  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  61.46 
 
 
698 aa  874  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  60.4 
 
 
703 aa  863  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  60.14 
 
 
704 aa  846  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  61.17 
 
 
702 aa  865  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  63.62 
 
 
689 aa  917  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  60.34 
 
 
706 aa  867  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  56.21 
 
 
714 aa  838  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  66.14 
 
 
689 aa  940  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  65.56 
 
 
692 aa  935  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  61.17 
 
 
702 aa  865  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  62.48 
 
 
699 aa  901  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  63 
 
 
701 aa  878  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  62.48 
 
 
700 aa  889  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  62.09 
 
 
700 aa  869  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  62.25 
 
 
702 aa  874  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  62.09 
 
 
705 aa  875  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  65.85 
 
 
692 aa  940  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  60.63 
 
 
692 aa  865  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  62.91 
 
 
692 aa  886  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  64.22 
 
 
703 aa  885  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  62.48 
 
 
706 aa  871  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  60.74 
 
 
699 aa  842  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.15857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  61.69 
 
 
701 aa  874  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  64.29 
 
 
699 aa  889  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  60.28 
 
 
704 aa  840  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  67 
 
 
689 aa  962  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  63.39 
 
 
690 aa  890  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  61.45 
 
 
698 aa  853  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  61.74 
 
 
689 aa  884  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  64.8 
 
 
691 aa  938  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  66.38 
 
 
691 aa  936  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  86.52 
 
 
705 aa  1251  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  77.36 
 
 
698 aa  1109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  59.48 
 
 
699 aa  861  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  64.71 
 
 
691 aa  925  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  65.8 
 
 
691 aa  925  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29790  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  59.63 
 
 
700 aa  832  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.527454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  65.17 
 
 
695 aa  890  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  58.92 
 
 
704 aa  832  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  62.37 
 
 
700 aa  856  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  61.37 
 
 
701 aa  871  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  61.52 
 
 
700 aa  867  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>