More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09860 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  84.85 
 
 		 132 aa  228  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  82.58 
 
 		 132 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  69.7 
 
 		 132 aa  196  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  60.61 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  163  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  56.06 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  60.15 
 
 		 134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  58.52 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  58.82 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  157  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 135 aa  156  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  58.33 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000012409  unclonable  0.0000000000562401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  57.78 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101428  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000574269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001728  SSU ribosomal protein S8p (S15Ae)  58.33 
 
 		 130 aa  149  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000120739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>