38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09740  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000943193  hitchhiker  0.0000123318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08620  tRNA-Tyr  95.29 
 
 		 84 bp  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000490301  hitchhiker  0.0000012455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  91.94 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  90 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0030  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0060  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00028228  normal  0.398472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0065  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0649781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0023  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0731  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>