299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0026  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08640  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0016  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000151702  hitchhiker  0.0080631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0007  tRNA-Met  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0031  tRNA-Met  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0049  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0050  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000010044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0024  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  100 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  100 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  100 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.207182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0276  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.66107e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0486  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.212105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0034  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0026  tRNA-Met  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000311751  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00143134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0035  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.849815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-8  tRNA-Met  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000362106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0034  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.62589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>