More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09670 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  81.46 
 
 		 176 aa  297  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  74.72 
 
 		 178 aa  278  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  62.57 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  55.62 
 
 		 174 aa  204  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  52.72 
 
 		 266 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  52.54 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.27 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  49.44 
 
 		 266 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  49.47 
 
 		 267 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  51.32 
 
 		 306 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 246 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  51.69 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  52.27 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  49.44 
 
 		 175 aa  187  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  47.64 
 
 		 272 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  49.17 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  52.27 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  51.7 
 
 		 194 aa  184  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  45.88 
 
 		 266 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  47.13 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  47.85 
 
 		 272 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  46.35 
 
 		 270 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  46.35 
 
 		 270 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  48.37 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 280 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  49.17 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.54 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  46.35 
 
 		 271 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  53.37 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  51.38 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  49.71 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  48.19 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  47.18 
 
 		 276 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 273 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  48.86 
 
 		 277 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  46.77 
 
 		 273 aa  178  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  50 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  47.92 
 
 		 299 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  50.28 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  48.13 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  46.7 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  52.25 
 
 		 175 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  47.83 
 
 		 267 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  47.54 
 
 		 287 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  50.27 
 
 		 228 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  44.86 
 
 		 301 aa  171  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  52 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  47.73 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  48.88 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  48.33 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  48.33 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  46.37 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.33 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 175 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  43.75 
 
 		 296 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  47.03 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  45.36 
 
 		 275 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  45.41 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  47.22 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  45.31 
 
 		 317 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  48 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.15 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  45.51 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  46.67 
 
 		 242 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 		 175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  45.25 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  45.56 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  45.56 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  47.22 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  49.71 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  46.63 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>