292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09630 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 161 aa  329  8e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  56.29 
 
 		 157 aa  175  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  53.42 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  52.78 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  54.07 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  51.77 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  49.67 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  48.7 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  52.21 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  46.48 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  49.34 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  46.72 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  44.44 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  48.43 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  42.95 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  42.95 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  41.45 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  45.59 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  41.5 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  38.75 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  40.13 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  38.82 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  38.82 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  38.82 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  38.16 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  38.16 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  38.16 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  40.62 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  46.4 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  40.52 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  42.73 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.55 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.14 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40.97 
 
 		 156 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40.97 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  34.16 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  39.35 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  40.14 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  38.82 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  35.92 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  37.01 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  35.33 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.75 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  37.01 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  35.95 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  40.3 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  36.48 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  41.09 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  36.67 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  35.57 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  40.31 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  40.31 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  38.73 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  39.66 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  38.1 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  37.04 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.49 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  38.05 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  35.25 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  37.67 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>