More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09210 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  59.66 
 
 
244 aa  262  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  58.26 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.83 
 
 
219 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  50.27 
 
 
219 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.11 
 
 
207 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.48 
 
 
212 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.93 
 
 
213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.44 
 
 
217 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.93 
 
 
210 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.16 
 
 
206 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.08 
 
 
207 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.6 
 
 
236 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.58 
 
 
216 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  42.86 
 
 
213 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.29 
 
 
226 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.4 
 
 
226 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.03 
 
 
233 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.22 
 
 
686 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.1 
 
 
221 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.15 
 
 
202 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.6 
 
 
671 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.28 
 
 
210 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.57 
 
 
222 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39.61 
 
 
216 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.13 
 
 
221 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.6 
 
 
203 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.73 
 
 
207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  47.85 
 
 
688 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.62 
 
 
213 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  48.09 
 
 
232 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.31 
 
 
205 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.59 
 
 
688 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.08 
 
 
207 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  43.85 
 
 
206 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.36 
 
 
234 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.39 
 
 
215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.54 
 
 
207 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  42.79 
 
 
215 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  37.38 
 
 
210 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.98 
 
 
234 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.68 
 
 
218 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.58 
 
 
204 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.18 
 
 
214 aa  148  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  37.91 
 
 
210 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.75 
 
 
208 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  39.58 
 
 
211 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  44.56 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.71 
 
 
224 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.62 
 
 
901 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  38.74 
 
 
225 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.48 
 
 
208 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  37.39 
 
 
236 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.54 
 
 
211 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  40.95 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.56 
 
 
220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  42.79 
 
 
215 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.38 
 
 
216 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  42.01 
 
 
225 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.83 
 
 
210 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  40.38 
 
 
212 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.35 
 
 
224 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.18 
 
 
215 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  36.92 
 
 
225 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  42.79 
 
 
225 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  40.88 
 
 
203 aa  143  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  39.72 
 
 
217 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.49 
 
 
206 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  35.24 
 
 
211 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.45 
 
 
210 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.15 
 
 
204 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.16 
 
 
211 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  43.43 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.39 
 
 
206 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  39.52 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.79 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.08 
 
 
217 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  40.98 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.74 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.18 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.36 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.79 
 
 
223 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  43.08 
 
 
244 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.8 
 
 
214 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.11 
 
 
210 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  40.74 
 
 
219 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  39.52 
 
 
243 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  37.62 
 
 
213 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  41.1 
 
 
217 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.15 
 
 
205 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.06 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  45.14 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  43.08 
 
 
244 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  43.75 
 
 
206 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  39.71 
 
 
214 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  41.1 
 
 
217 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.32 
 
 
686 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  42.44 
 
 
209 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  43.59 
 
 
205 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.01 
 
 
208 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>