63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09130 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  100 
 
 		 326 aa  672    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  54.57 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  49.67 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  43.46 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  39.61 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  39.06 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  38.35 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  35.02 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  33.22 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  33.56 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  34.49 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  35.25 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.49 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 374 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 		 371 aa  125  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  28.12 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.16 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  27.78 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1011  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.66 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.486983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1594  radical SAM domain-containing protein  73.91 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2097  radical SAM family protein  31.03 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>