248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08320 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  62.33 
 
 
596 aa  792    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  100 
 
 
592 aa  1240    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  55.31 
 
 
595 aa  689    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  56.68 
 
 
590 aa  719    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  53.99 
 
 
619 aa  631  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  50.26 
 
 
589 aa  601  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  50.87 
 
 
611 aa  569  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  36.82 
 
 
522 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.28 
 
 
603 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  24.26 
 
 
622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
622 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  31.42 
 
 
300 aa  157  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.72 
 
 
227 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.26 
 
 
227 aa  143  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  28.23 
 
 
304 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  30.32 
 
 
232 aa  96.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  26.49 
 
 
383 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  24.21 
 
 
267 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.95 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  33.66 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  31.15 
 
 
291 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.24 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  32.24 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.13 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
237 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  39.62 
 
 
247 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.42 
 
 
256 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  27.04 
 
 
249 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  26.8 
 
 
616 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  28.14 
 
 
305 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  28.1 
 
 
254 aa  61.6  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
261 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.3 
 
 
250 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.89 
 
 
232 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
246 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  27.24 
 
 
307 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  46.55 
 
 
244 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  26.91 
 
 
311 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  46.67 
 
 
388 aa  57.4  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
249 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  42.47 
 
 
227 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  26.91 
 
 
311 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.46 
 
 
564 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  44.07 
 
 
384 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  50 
 
 
383 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  43.84 
 
 
227 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  25.39 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  42.47 
 
 
228 aa  55.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  29.63 
 
 
630 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  40.85 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
228 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
591 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  26.91 
 
 
311 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  29.59 
 
 
241 aa  54.7  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  37.31 
 
 
374 aa  54.7  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 
263 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.64 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.36 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.66 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  26.24 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  44.44 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  42.86 
 
 
385 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 
229 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
254 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  44.44 
 
 
253 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  44.64 
 
 
229 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  40.3 
 
 
248 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  36.67 
 
 
253 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.75 
 
 
393 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  44.07 
 
 
393 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  39.13 
 
 
399 aa  51.6  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
372 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
393 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
230 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  41.82 
 
 
392 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.03 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
230 aa  51.2  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.71 
 
 
247 aa  50.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
223 aa  50.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  42.65 
 
 
225 aa  50.8  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.62 
 
 
400 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
246 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  21.63 
 
 
324 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  38.81 
 
 
245 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
242 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.21 
 
 
357 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1335  histidinol-phosphate phosphatase  29.47 
 
 
417 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0371324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  33.68 
 
 
243 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1839  hypothetical protein  26.49 
 
 
263 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1804  hypothetical protein  26.49 
 
 
263 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  33.68 
 
 
237 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
234 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  34.38 
 
 
241 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  29.41 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.48 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 
222 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  41.07 
 
 
384 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
514 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>