More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07190 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly02  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly03  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.122122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0044  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0908576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t61  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.58231  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>