More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 315 aa  641    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  71.57 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  61.31 
 
 		 307 aa  367  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  51.8 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.23 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.23 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  50.49 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  48.85 
 
 		 328 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  45.75 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  43.79 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  45.95 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  39.94 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  39.53 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  33.48 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.05 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.25 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  32.48 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  32.24 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.64 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  28.33 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3407  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  27.88 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  33.73 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  29.6 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  34.34 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.27 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  25.74 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.3 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  26.25 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  24.5 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.02 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  26.15 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>