More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06570 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 575 aa  1193    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 583 aa  704    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  74.09 
 
 		 575 aa  897    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 614 aa  580  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 557 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 559 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 556 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 560 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 586 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 556 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 564 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 575 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 584 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 550 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 592 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 568 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 554 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 560 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 611 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 550 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 564 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 550 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 587 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 605 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 559 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 586 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 602 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 598 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 592 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>