245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06480 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  79.66 
 
 		 484 aa  764    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 483 aa  958    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  63.79 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  64.79 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  63.01 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  58.44 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  52.04 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  47.21 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  50.97 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  38.73 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  38.93 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  38.73 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.73 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.24 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  38.24 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  38.24 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  38.24 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.99 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.48 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  37.99 
 
 		 446 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.91 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.21 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.19 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  39.47 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.97 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.73 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 		 460 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.17 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  38.27 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  36.21 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.58 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.86 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.33 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  38.68 
 
 		 453 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.3 
 
 		 475 aa  256  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.01 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.01 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 		 470 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.76 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.76 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.76 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.39 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.62 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.87 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.26 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.87 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.52 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.76 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.19 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.8 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.93 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.52 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 461 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  37.59 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.82 
 
 		 464 aa  249  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.46 
 
 		 450 aa  249  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.38 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.54 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.65 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.65 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.34 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.4 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.07 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.07 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  37.34 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.07 
 
 		 452 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  35.31 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  36.01 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  35.75 
 
 		 466 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  36.41 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  34.68 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  34.68 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.17 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.86 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.37 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 		 488 aa  229  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  33.73 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.32 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  31.2 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  31.87 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.57 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.26 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.1 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  30.64 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 		 486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  36.19 
 
 		 451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>