More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06450 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2327  uracil-xanthine permease  78.45 
 
 
468 aa  706    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04600  uracil-xanthine permease  78.52 
 
 
467 aa  707    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0641313  hitchhiker  0.000000425239 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  100 
 
 
469 aa  924    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  59.33 
 
 
447 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  45.58 
 
 
409 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  43.97 
 
 
403 aa  339  7e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  45.19 
 
 
403 aa  335  9e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  43.06 
 
 
415 aa  332  9e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  43.9 
 
 
399 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  43.9 
 
 
399 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  42.36 
 
 
395 aa  315  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  42.02 
 
 
430 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  46.13 
 
 
433 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  44.47 
 
 
394 aa  300  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  38.39 
 
 
430 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  40.27 
 
 
427 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  42.48 
 
 
411 aa  295  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  38.71 
 
 
435 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  38.71 
 
 
435 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  39.37 
 
 
438 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  39.37 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  39.37 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  39.37 
 
 
427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  39.5 
 
 
417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  39.37 
 
 
427 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  39.37 
 
 
427 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  39.37 
 
 
427 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  39.37 
 
 
427 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  40.52 
 
 
412 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  40.28 
 
 
430 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  39.49 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  41.71 
 
 
412 aa  286  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  40.23 
 
 
436 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  40 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  40.43 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  39.86 
 
 
418 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  37.84 
 
 
423 aa  280  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  37.93 
 
 
417 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  38.26 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  38.11 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  38.3 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  38.39 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  39.48 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  38.39 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  38.03 
 
 
421 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  39.53 
 
 
441 aa  274  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  39.68 
 
 
425 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  38.03 
 
 
421 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  38.03 
 
 
421 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  37.39 
 
 
417 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  40.76 
 
 
413 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  39.76 
 
 
425 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.43 
 
 
423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  38.46 
 
 
406 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  36.9 
 
 
427 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  38.33 
 
 
425 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  38.1 
 
 
427 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  39.58 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  37.62 
 
 
427 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  39.68 
 
 
434 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  37.56 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  39.35 
 
 
432 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  39.35 
 
 
432 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 
432 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  39.41 
 
 
443 aa  264  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  39.71 
 
 
416 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  39.17 
 
 
423 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  38.1 
 
 
419 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  38.92 
 
 
420 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  37.18 
 
 
441 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  36.99 
 
 
411 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 
425 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  37.86 
 
 
415 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  38.69 
 
 
416 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  38.69 
 
 
416 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  37.44 
 
 
429 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.29 
 
 
429 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  37.44 
 
 
429 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.29 
 
 
429 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  37.44 
 
 
429 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  38.23 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  39.76 
 
 
434 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  38.14 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  39.43 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  37.44 
 
 
412 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  38.23 
 
 
416 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  39.1 
 
 
412 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  35.92 
 
 
429 aa  252  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  37.79 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  38.86 
 
 
412 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  35.27 
 
 
428 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  35.27 
 
 
428 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>