More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05910 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  100 
 
 
464 aa  954  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  7.37737e-06 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  44.37 
 
 
447 aa  356  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  44.71 
 
 
451 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  57.14 
 
 
185 aa  148  2e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
167 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  47.62 
 
 
143 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  52.07 
 
 
144 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
133 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
142 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
131 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
132 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
132 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
132 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  47.79 
 
 
116 aa  123  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
151 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
127 aa  120  5e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  2.46532e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
133 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
139 aa  115  2e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  40.16 
 
 
130 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  42.74 
 
 
132 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  37.4 
 
 
130 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
187 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
132 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  41.8 
 
 
131 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
128 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  40.98 
 
 
129 aa  100  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  41.6 
 
 
131 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  40.8 
 
 
131 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
328 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  27.34 
 
 
328 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
348 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  27.74 
 
 
328 aa  84.3  4e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
328 aa  84.3  4e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  24.67 
 
 
348 aa  84.3  5e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  24.08 
 
 
319 aa  83.2  9e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  23.34 
 
 
320 aa  82.8  1e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 
328 aa  82  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 
328 aa  82.4  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
152 aa  82  2e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
322 aa  78.2  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 
334 aa  77.8  4e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
327 aa  76.6  9e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
338 aa  75.1  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
342 aa  74.7  3e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
370 aa  75.1  3e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
327 aa  75.1  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
327 aa  75.1  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
327 aa  75.1  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
327 aa  75.1  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  24.66 
 
 
327 aa  75.1  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
328 aa  73.9  5e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
354 aa  73.2  1e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
329 aa  72  2e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 
334 aa  72.4  2e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  24.32 
 
 
327 aa  71.6  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.95 
 
 
349 aa  70.9  4e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
360 aa  70.9  4e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.95 
 
 
349 aa  71.2  4e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
667 aa  70.9  5e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.25 
 
 
327 aa  69.3  1e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
327 aa  68.2  3e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  23.51 
 
 
345 aa  68.2  3e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  33.82 
 
 
162 aa  68.6  3e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.44 
 
 
319 aa  67.8  4e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  35.11 
 
 
461 aa  67  6e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.91 
 
 
327 aa  67  7e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
329 aa  66.6  9e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.18 
 
 
349 aa  66.6  9e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 
329 aa  66.6  9e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.91 
 
 
327 aa  65.5  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 
328 aa  65.9  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
321 aa  65.5  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  30.43 
 
 
151 aa  65.5  2e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  32.77 
 
 
488 aa  64.7  3e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  23.83 
 
 
328 aa  64.7  3e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
371 aa  63.2  9e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
665 aa  63.2  9e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  39 
 
 
472 aa  63.2  1e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 
324 aa  63.2  1e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
338 aa  63.2  1e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
349 aa  62.8  1e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.91 
 
 
481 aa  62.4  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  32.06 
 
 
143 aa  62  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2338  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
173 aa  62.4  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.65 
 
 
338 aa  62.4  2e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  53.7 
 
 
73 aa  62.4  2e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  27.54 
 
 
333 aa  62  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.36 
 
 
379 aa  62  2e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  35.24 
 
 
495 aa  61.6  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3605  bifunctional ADP-heptose synthase  57.14 
 
 
168 aa  61.2  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3475  rfaE bifunctional protein  34.07 
 
 
475 aa  61.6  3e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
331 aa  61.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
329 aa  61.2  4e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
665 aa  60.8  5e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
332 aa  60.8  5e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  34.06 
 
 
468 aa  60.8  5e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  22.41 
 
 
328 aa  60.8  5e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  29.94 
 
 
330 aa  60.8  5e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
336 aa  60.8  5e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  24.32 
 
 
331 aa  60.5  6e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.93287e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>