More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  85.55 
 
 		 198 aa  306  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  78.45 
 
 		 197 aa  299  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  67.25 
 
 		 193 aa  241  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  60.98 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 277 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  60.87 
 
 		 182 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  57.83 
 
 		 222 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 351 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  59.04 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  58.43 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  60.13 
 
 		 182 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  56.8 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  59.04 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  57.71 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  53.76 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 172 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  52.66 
 
 		 329 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  57.65 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  56.89 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  53.94 
 
 		 396 aa  198  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  57.41 
 
 		 357 aa  197  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 356 aa  197  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 415 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  60.13 
 
 		 177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  51.15 
 
 		 401 aa  194  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  59.48 
 
 		 179 aa  194  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  57.52 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  55.09 
 
 		 183 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 253 aa  191  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 177 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 183 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 183 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  54.6 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  56.73 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  56.96 
 
 		 168 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.18 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  51.76 
 
 		 172 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  56.36 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.61 
 
 		 154 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 		 180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  54.76 
 
 		 180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 		 180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  54.82 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  55.92 
 
 		 156 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 154 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  51.25 
 
 		 176 aa  181  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 177 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 173 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  55.09 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  55.09 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  51.85 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>