115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05410 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  100 
 
 
312 aa  637  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  2.45308e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  54.8 
 
 
552 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.88494e-05  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  46.92 
 
 
314 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  48.29 
 
 
253 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.46678e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  46.05 
 
 
246 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  43.35 
 
 
264 aa  196  5e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  43.78 
 
 
258 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  44.07 
 
 
259 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  41.81 
 
 
234 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  41.81 
 
 
234 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  43.67 
 
 
247 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  42.51 
 
 
264 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  43.23 
 
 
249 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  3.70224e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  44.84 
 
 
249 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  41.84 
 
 
272 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  41.32 
 
 
258 aa  190  3e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.35983e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  43.24 
 
 
252 aa  189  6e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  1.59017e-10  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  40.98 
 
 
286 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  41.18 
 
 
267 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  37.98 
 
 
262 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  36.86 
 
 
275 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  41.77 
 
 
273 aa  180  3e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  37.96 
 
 
432 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  42.36 
 
 
246 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  1.54426e-06  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  41.63 
 
 
239 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  38.04 
 
 
262 aa  174  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  39.22 
 
 
260 aa  174  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  41.59 
 
 
263 aa  173  4e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  39.5 
 
 
419 aa  172  6e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  36.88 
 
 
272 aa  172  6e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  39.83 
 
 
236 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  38.59 
 
 
254 aa  164  2e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  39.74 
 
 
246 aa  164  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  38.96 
 
 
248 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  38.96 
 
 
248 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  36.1 
 
 
242 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  37.77 
 
 
271 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  39.91 
 
 
249 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  37.1 
 
 
259 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  37.9 
 
 
262 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  34.48 
 
 
270 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  48.21 
 
 
371 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  37.28 
 
 
335 aa  153  3e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  32.83 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  37.34 
 
 
276 aa  148  1e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  32.83 
 
 
268 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  145  7e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  32.92 
 
 
232 aa  140  2e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  32.92 
 
 
232 aa  141  2e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  32.95 
 
 
265 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  34.41 
 
 
287 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  32.34 
 
 
285 aa  137  3e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  45.89 
 
 
284 aa  131  1e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  35.29 
 
 
313 aa  131  2e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  45.58 
 
 
303 aa  129  5e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  34.33 
 
 
259 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  30.37 
 
 
229 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  27.99 
 
 
334 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.99479e-07  unclonable  1.29019e-08 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  28.88 
 
 
279 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  29.63 
 
 
251 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  39.69 
 
 
225 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  29.06 
 
 
249 aa  82.4  8e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  29.46 
 
 
253 aa  81.3  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.17 
 
 
253 aa  80.5  3e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28.75 
 
 
253 aa  79.3  8e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  37.61 
 
 
275 aa  77.8  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.19 
 
 
272 aa  75.1  1e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  24.58 
 
 
319 aa  71.6  2e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  33.66 
 
 
160 aa  68.6  1e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  29.14 
 
 
275 aa  68.2  2e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0449  hypothetical protein  32.77 
 
 
251 aa  65.9  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.924551  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  25.51 
 
 
311 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  25.51 
 
 
311 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  25.51 
 
 
311 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  23.33 
 
 
264 aa  63.5  4e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3450  hypothetical protein  38.6 
 
 
375 aa  61.6  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0757309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  30.83 
 
 
501 aa  61.2  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  27.82 
 
 
421 aa  61.6  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  31.01 
 
 
564 aa  60.5  3e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  26.67 
 
 
440 aa  60.5  3e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  23.87 
 
 
299 aa  60.8  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  31.51 
 
 
412 aa  60.8  3e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  30.83 
 
 
507 aa  60.8  3e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28.48 
 
 
308 aa  60.5  4e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.28 
 
 
480 aa  60.5  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.77 
 
 
381 aa  60.5  4e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  30.83 
 
 
508 aa  60.5  4e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  30.28 
 
 
478 aa  60.5  4e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.08 
 
 
498 aa  59.3  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  30.08 
 
 
496 aa  59.7  7e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  30.08 
 
 
498 aa  59.7  7e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  30.08 
 
 
498 aa  59.7  7e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  22.76 
 
 
329 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  24.76 
 
 
268 aa  57.8  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>