More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05100 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 876 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 876 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 871 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 875 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 874 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 880 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 867 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 886 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 884 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 860 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 874 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 867 aa  694    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 874 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 879 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 860 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 860 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 899 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 886 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 871 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 875 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 874 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 886 aa  661    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 904 aa  686    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 875 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  42.86 
 
 		 873 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 874 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 882 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 897 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 896 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 876 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 880 aa  741    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 864 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 886 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 899 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 872 aa  648    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 881 aa  717    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 874 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 905 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 891 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 865 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 876 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 875 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 890 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 874 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 876 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 874 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 880 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 868 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 931 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 884 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 872 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 878 aa  755    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 874 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 897 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1359  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 882 aa  646    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00180995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 865 aa  695    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 892 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 879 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 879 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 874 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 871 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 874 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 874 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 876 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 874 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 880 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 874 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 874 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 874 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 863 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 897 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 859 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 875 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 876 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 897 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 885 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 892 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 874 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 874 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 892 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 878 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 874 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 900 aa  666    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 863 aa  697    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 879 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 876 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>