More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04780 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  100 
 
 		 445 aa  874    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  57.27 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  48.12 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  48.68 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  46.46 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  46.14 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  47.64 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  46.41 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  47.26 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  46.46 
 
 		 445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.19 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  46.37 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  45.93 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  45.69 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  45.54 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  45.2 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  45.22 
 
 		 440 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  44.96 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  47.28 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  43.62 
 
 		 447 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  45.57 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  45.81 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  45.97 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  45.07 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.32 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  47.12 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  45.7 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  45.07 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.07 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  45.07 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  45.07 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  43.81 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  43.84 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  41.24 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  42.66 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  44.13 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  41.86 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  42.46 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  41.12 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  43.97 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  43.03 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  39.63 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  41.53 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.63 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  39.72 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  41.63 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  41.63 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  41.4 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  43.66 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 417 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  42.63 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.95 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  42.03 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  38.37 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  35.63 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.33 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  36.19 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  34.32 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  35.22 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  36.11 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  33.95 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  35.22 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  37.94 
 
 		 424 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  32.89 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  33.11 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  36.78 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  35.48 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  37.05 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  38.17 
 
 		 424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  35.48 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 439 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  36.64 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  35.95 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  34.99 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  35.48 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  35.15 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  35.15 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  33.41 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  35.15 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  35.48 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  35.02 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  35.48 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  34.98 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  36.43 
 
 		 442 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  35.48 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.88 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>