More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04010 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  44.6 
 
 		 727 aa  686    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  44.6 
 
 		 727 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.8 
 
 		 716 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000855141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.49 
 
 		 727 aa  685    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  44.49 
 
 		 716 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.76 
 
 		 716 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000534468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  71.98 
 
 		 802 aa  1140    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.1 
 
 		 793 aa  714    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  44.6 
 
 		 727 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  46.71 
 
 		 775 aa  678    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.42 
 
 		 804 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  44.46 
 
 		 727 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  44.6 
 
 		 727 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  44.87 
 
 		 727 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  44.6 
 
 		 727 aa  686    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.71 
 
 		 729 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.52 
 
 		 716 aa  646    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.55 
 
 		 726 aa  731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000567155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  43.19 
 
 		 729 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  47.78 
 
 		 814 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.05 
 
 		 710 aa  683    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.43 
 
 		 724 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000566061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.62 
 
 		 790 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  49.01 
 
 		 786 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.99 
 
 		 817 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.02 
 
 		 726 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.69 
 
 		 763 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.96 
 
 		 725 aa  715    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.27 
 
 		 790 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  46.61 
 
 		 815 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  100 
 
 		 856 aa  1776    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.17 
 
 		 714 aa  713    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  44.9 
 
 		 716 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000013827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.98 
 
 		 787 aa  675    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.438652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.1 
 
 		 813 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  44.46 
 
 		 727 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.19 
 
 		 781 aa  827    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  0.0000697847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.63 
 
 		 795 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.5 
 
 		 716 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.58 
 
 		 781 aa  696    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  46 
 
 		 717 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.08 
 
 		 861 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1376  (p)ppGpp synthetase I  45.24 
 
 		 862 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  0.0959859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.43 
 
 		 721 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 		 806 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.71 
 
 		 822 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.55 
 
 		 712 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  44.6 
 
 		 727 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000280159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.4 
 
 		 779 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.2 
 
 		 827 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  46.55 
 
 		 790 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000342988  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  46.73 
 
 		 812 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.93 
 
 		 727 aa  693    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 		 801 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.95 
 
 		 742 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.21 
 
 		 727 aa  672    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  44.11 
 
 		 726 aa  679    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  43.8 
 
 		 726 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  43.19 
 
 		 729 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  49.38 
 
 		 785 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2116  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.93 
 
 		 807 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0339196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.72 
 
 		 721 aa  650    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.12 
 
 		 738 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5139  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.15 
 
 		 879 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  45.53 
 
 		 734 aa  682    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2308  RelA/SpoT family protein  46.47 
 
 		 790 aa  673    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0636363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.24 
 
 		 727 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  0.000000120051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.68 
 
 		 726 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  42.78 
 
 		 748 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  42.65 
 
 		 750 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0704  GTP diphosphokinase  45.01 
 
 		 783 aa  643    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.21 
 
 		 797 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.02 
 
 		 815 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  48.18 
 
 		 759 aa  692    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.42 
 
 		 820 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.71 
 
 		 766 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  47.16 
 
 		 743 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.29 
 
 		 716 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  44.44 
 
 		 774 aa  656    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 		 801 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.55 
 
 		 788 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  64.13 
 
 		 789 aa  1021    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  45.96 
 
 		 809 aa  673    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.79 
 
 		 733 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.33 
 
 		 732 aa  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.55 
 
 		 732 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.32 
 
 		 745 aa  634  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.97 
 
 		 751 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.14 
 
 		 717 aa  635  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.17 
 
 		 721 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  43.16 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  42.7 
 
 		 729 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  43.48 
 
 		 728 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.15 
 
 		 771 aa  628  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.31 
 
 		 746 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.74 
 
 		 746 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0175  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.44 
 
 		 740 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.57 
 
 		 750 aa  625  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0092  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  43.17 
 
 		 740 aa  622  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.74 
 
 		 746 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>