More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03650 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  65.19 
 
 		 608 aa  759    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  65.78 
 
 		 599 aa  795    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 596 aa  1217    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  53.85 
 
 		 580 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  53.04 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.14 
 
 		 581 aa  552  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.69 
 
 		 597 aa  548  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.05 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  43.19 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  43.11 
 
 		 573 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  45.13 
 
 		 619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.86 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  41.16 
 
 		 593 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  40.66 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.79 
 
 		 583 aa  422  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  36.7 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  36.7 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.32 
 
 		 1091 aa  408  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.79 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.66 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.02 
 
 		 611 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.3 
 
 		 597 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.64 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.97 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.52 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.51 
 
 		 596 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.35 
 
 		 577 aa  343  7e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  39.6 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.89 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.14 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 618 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.73 
 
 		 593 aa  332  8e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  36.79 
 
 		 611 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.47 
 
 		 588 aa  326  6e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  36.87 
 
 		 677 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.83 
 
 		 579 aa  323  7e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 590 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.57 
 
 		 627 aa  322  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.08 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.45 
 
 		 618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.26 
 
 		 1228 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.58 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.88 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 		 590 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  32.36 
 
 		 590 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.09 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  40.42 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.29 
 
 		 600 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.74 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.66 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.08 
 
 		 600 aa  306  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.51 
 
 		 1194 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.95 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.67 
 
 		 576 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.8 
 
 		 577 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.8 
 
 		 577 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.27 
 
 		 574 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.5 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.11 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.5 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.32 
 
 		 603 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 		 612 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.5 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  34.98 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.15 
 
 		 607 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.21 
 
 		 579 aa  290  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.58 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.22 
 
 		 1138 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.76 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.45 
 
 		 598 aa  286  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  32.83 
 
 		 609 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  30.22 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.79 
 
 		 583 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  35.82 
 
 		 597 aa  283  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  35.92 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 		 585 aa  280  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.8 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  34.58 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.03 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.32 
 
 		 595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.63 
 
 		 574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.99 
 
 		 596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.28 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.67 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  35.57 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.69 
 
 		 627 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.54 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.91 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  32.29 
 
 		 611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 619 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  34.09 
 
 		 624 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.81 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>