More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03480 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  100 
 
 		 416 aa  850    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  50.72 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 416 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  43.6 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  46.5 
 
 		 433 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  44.69 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  44.47 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.71 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  44.33 
 
 		 440 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 441 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  42.54 
 
 		 439 aa  348  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  41.61 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  42.2 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  42.17 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  43.85 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  40.54 
 
 		 416 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  40.92 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  42.16 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 399 aa  319  7e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 611 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.66 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  42.39 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.94 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.94 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  36.39 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.65 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  38.17 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  41.9 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.68 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 377 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.6 
 
 		 406 aa  269  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  38.15 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 405 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.24 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.79 
 
 		 404 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 411 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.68 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.68 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.68 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.17 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.68 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.68 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.68 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.96 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 404 aa  259  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  34.36 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.34 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>