21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  29.93 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  28.18 
 
 
306 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  29.54 
 
 
279 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  28.28 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  24.48 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  24.14 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  23.79 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  28.9 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  26.84 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  24.58 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  24.22 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  24.22 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  24.03 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  22.07 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  23.22 
 
 
275 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  22.06 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>