139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02210 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  43.75 
 
 
197 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  49.43 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  35.14 
 
 
184 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40.12 
 
 
169 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.8 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.8 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.73 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.9 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  35.8 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.92 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.99 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.3 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.14 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.76 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.13 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  29.24 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.08 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.7 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.97 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.32 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  29.3 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  35.06 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  33.33 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  38.18 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.12 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  37.64 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  34.46 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  36.31 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.55 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  33.33 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.19 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  33.53 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  29.44 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  37.06 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  33.15 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  37.66 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  35 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  32.98 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  32.73 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  35.96 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  31.28 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  35.4 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  40.45 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  34.91 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  37.5 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  34.52 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  38.04 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  35.47 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  33.57 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.74 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  35.68 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  35.68 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  31.17 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.11 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  29.21 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  37.25 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  33.7 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  32.14 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  33.92 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  31.85 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  31.61 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  32.08 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  27.36 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  33.73 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35.58 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  33.14 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.2 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  37.84 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  31.82 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.86 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  34.06 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  30.05 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  31.48 
 
 
205 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  32.76 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  31.37 
 
 
187 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  31.35 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  31.65 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  31.65 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  29.63 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  33.53 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  35.76 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  43.75 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  30.77 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  37.96 
 
 
204 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  26.71 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  28.03 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  36.36 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  41.18 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  35.71 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  35.71 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  29.73 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  34.52 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  34.52 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  29.73 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  34.52 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>