More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02190 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  100 
 
 
436 aa  887  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  68.51 
 
 
437 aa  608  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  67.36 
 
 
435 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0111  dihydropteroate synthase  39.79 
 
 
490 aa  285  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.119932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  48.12 
 
 
278 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
274 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
279 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  1.50876e-07 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
286 aa  226  5e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  46.56 
 
 
291 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
313 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
400 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 
413 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 
279 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  4.48434e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  51.6 
 
 
302 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 
299 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 
277 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  46.54 
 
 
298 aa  221  1e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
280 aa  222  1e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 
287 aa  221  2e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.65095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  49.23 
 
 
281 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
299 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
299 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  45.31 
 
 
279 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.89 
 
 
277 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  44.22 
 
 
286 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
280 aa  217  3e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.18907e-05  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  47.19 
 
 
313 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.84102e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.48754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  46.74 
 
 
278 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  48.69 
 
 
332 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.38476e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
277 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.88358e-05  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
275 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
299 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 
282 aa  216  6e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.46067e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
313 aa  215  1e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.89 
 
 
277 aa  214  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
316 aa  214  3e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
277 aa  214  3e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  4.41656e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  45.02 
 
 
275 aa  213  5e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  213  5e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  47.94 
 
 
291 aa  213  6e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 
278 aa  212  8e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  46.83 
 
 
289 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
282 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
296 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 
272 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
296 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
296 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
298 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  46.44 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
296 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  46.44 
 
 
296 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
282 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
282 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
282 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
282 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
280 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  47.56 
 
 
265 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 
331 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.19 
 
 
277 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.06991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.14 
 
 
277 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.19 
 
 
277 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
292 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 
296 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 
279 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 
279 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 
278 aa  209  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.48147e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.06 
 
 
277 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.66046e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.19 
 
 
277 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.50562e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 
276 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
298 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  46.59 
 
 
280 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
277 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.09731e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  42.44 
 
 
277 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  42.37 
 
 
291 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  3.53988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  43.36 
 
 
282 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  44.8 
 
 
293 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 
277 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.69878e-06  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
286 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 
265 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 
277 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  45 
 
 
283 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
284 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.16741e-05  unclonable  3.96906e-12 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 
301 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.48 
 
 
397 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 
283 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 
277 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 
486 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  45 
 
 
307 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
277 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
299 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 
270 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.823203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>