More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02150 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02150  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
378 aa  775    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.36526  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2901  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.38 
 
 
371 aa  396  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05430  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.86 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.58 
 
 
489 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.31319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.93 
 
 
485 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.67 
 
 
470 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.01 
 
 
480 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.66 
 
 
509 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.23 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  28.49 
 
 
476 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.08 
 
 
476 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.92 
 
 
457 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.52 
 
 
457 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.42 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.31 
 
 
455 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.91 
 
 
521 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.23 
 
 
459 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  28.19 
 
 
470 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.67 
 
 
476 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.68 
 
 
462 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.92 
 
 
470 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.37 
 
 
476 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.92 
 
 
454 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.88 
 
 
476 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  25.88 
 
 
476 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  25.67 
 
 
476 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.64 
 
 
446 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.07 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  25.88 
 
 
476 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  25.88 
 
 
476 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.33 
 
 
456 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  25.88 
 
 
476 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.88 
 
 
476 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.65 
 
 
469 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  28.87 
 
 
471 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.41 
 
 
471 aa  99.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.79 
 
 
470 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.14 
 
 
524 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.68 
 
 
492 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  30.52 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.52 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.57 
 
 
306 aa  97.8  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.63 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.92 
 
 
476 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.42 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.54 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.1 
 
 
436 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  28.88 
 
 
468 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  25.34 
 
 
464 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.91 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.45 
 
 
456 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  30.46 
 
 
458 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.42 
 
 
311 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.63 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  31.87 
 
 
454 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1198  hypothetical protein  26.95 
 
 
454 aa  90.1  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013516 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.04 
 
 
457 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.55 
 
 
472 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.81 
 
 
450 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.77 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.55 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  27.9 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  32.48 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.86 
 
 
475 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.723741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.72 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  29.46 
 
 
354 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.42 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.24 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.43 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.57 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01899  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  29.27 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.69 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.29 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0991  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.16 
 
 
539 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0298578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.07 
 
 
465 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  26.95 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.45 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.68 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1815  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.195712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.45 
 
 
442 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.43 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.73 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.47 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 
682 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.52 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.39 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.98 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.84 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  27.8 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0016  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  25.61 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.49 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  25.2 
 
 
443 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.64 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.56 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.03 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.21 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>