More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01000 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  54.02 
 
 
189 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  51.91 
 
 
184 aa  190  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  52.76 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  49.38 
 
 
189 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  48.17 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  46.43 
 
 
181 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  46.95 
 
 
179 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  46.95 
 
 
179 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  46.95 
 
 
179 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  46.95 
 
 
179 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.72 
 
 
180 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.1 
 
 
180 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
180 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
180 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
180 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
180 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  49.39 
 
 
181 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  50 
 
 
181 aa  141  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  49.39 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.42 
 
 
179 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.17 
 
 
181 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  39.66 
 
 
179 aa  134  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.9 
 
 
194 aa  134  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  38.51 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  43.29 
 
 
176 aa  131  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.21 
 
 
175 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2857  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.14 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.18 
 
 
153 aa  85.5  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.45 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.7 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.71 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.62 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  36.91 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  29.52 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.9 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  37.6 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.34 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.34 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.12 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  36.24 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.75 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.89 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.48 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  37.07 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  37.1 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  37.07 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.11 
 
 
256 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.52 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  34.75 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  32.79 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  37.07 
 
 
213 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.68 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  35.07 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.04 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  36.13 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  29.17 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>