65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00970 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  100 
 
 		 217 aa  433  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  53.92 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  52.53 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  50.92 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  47.32 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  46.08 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.43 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  45.98 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  47.32 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  37.22 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  37.04 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1864  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.39 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.31142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.31 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0319  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.49 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  31.63 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  26.61 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  27.06 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  27.06 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  26.61 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  26.61 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  26.61 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  23.58 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  26.29 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  24.52 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  25.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  23.85 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.82 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.82 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  25.46 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  24.88 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  21.7 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.78 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  37.63 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.98 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  28.48 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  26.4 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.7 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.7 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  27.06 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  35.48 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.94 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.57 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  26.06 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  21.76 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  35.63 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  35.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  23.03 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.45 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.41 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  26.6 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.86 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  25.68 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  24.59 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  24.59 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  26.98 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>