More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00910 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  100 
 
 
177 aa  353  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  44.57 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  42.53 
 
 
181 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  42.53 
 
 
181 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  42.53 
 
 
181 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  42.53 
 
 
181 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  42.53 
 
 
181 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  43.2 
 
 
175 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 
180 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.96 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  41.57 
 
 
180 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.41 
 
 
153 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.88 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.21 
 
 
188 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.7 
 
 
674 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.99 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  40 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  40 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  39.38 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  40.94 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.31 
 
 
674 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.57 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.65 
 
 
671 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  41.14 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.84 
 
 
176 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  37.58 
 
 
157 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  36.97 
 
 
157 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  36.97 
 
 
157 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  36.97 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4499  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.86 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.249413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  38.79 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.63 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.33 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.25 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.9 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.63 
 
 
667 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  37.06 
 
 
162 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  37.06 
 
 
162 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.06 
 
 
162 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0133  hydrogenase-3 small subunit  39.47 
 
 
211 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.952197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
208 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.75 
 
 
162 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.5 
 
 
189 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  37.06 
 
 
162 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  37.06 
 
 
162 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.66 
 
 
671 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.71 
 
 
208 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.66 
 
 
671 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  35.91 
 
 
205 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  33.52 
 
 
185 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.57 
 
 
205 aa  104  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.52 
 
 
185 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  36.46 
 
 
205 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  33.52 
 
 
185 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  37.57 
 
 
205 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3187  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.11 
 
 
177 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  37.57 
 
 
205 aa  104  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  37.57 
 
 
205 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  37.57 
 
 
205 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.46 
 
 
205 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1426  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
190 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  35.91 
 
 
205 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.41 
 
 
177 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
202 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
173 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.35 
 
 
212 aa  101  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000613847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2858  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.47 
 
 
208 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.874792 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  33.33 
 
 
203 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00930  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  37.65 
 
 
199 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  34.04 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  34.04 
 
 
203 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.04 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  34.04 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  34.04 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  34.04 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  34.04 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  34.04 
 
 
203 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.04 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  33.33 
 
 
203 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  34.04 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  33.14 
 
 
659 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  33.14 
 
 
659 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.14 
 
 
659 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  33.51 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>