24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 
110 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  41.51 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  34.15 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  36.84 
 
 
101 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  40 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.21 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.52 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.38 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  35.71 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  37.04 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.96 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.42 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.39 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  32.76 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  34.78 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  32.76 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  37.25 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.22 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  40.43 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  29.31 
 
 
87 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.3 
 
 
87 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  34.48 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  26.98 
 
 
92 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>