16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00820 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 764 aa  1560    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  50 
 
 		 863 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  32.74 
 
 		 845 aa  73.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0375  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2320 aa  70.1  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  41.9 
 
 		 2281 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00100  putative cell wall binding protein  36.97 
 
 		 172 aa  69.3  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  31.03 
 
 		 1104 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.66 
 
 		 2272 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.07 
 
 		 2179 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  23.84 
 
 		 2136 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  36.84 
 
 		 4881 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  36.59 
 
 		 1256 aa  46.6  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  33.33 
 
 		 4909 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1404  cell wall surface anchor family protein  27.43 
 
 		 308 aa  45.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  28.99 
 
 		 920 aa  45.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 		 2553 aa  43.9  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>