29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  100 
 
 
480 aa  949    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  87.28 
 
 
482 aa  741    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  66.39 
 
 
475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  25.35 
 
 
549 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  31.3 
 
 
539 aa  84  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  30.36 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  27.38 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  24.07 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  24.27 
 
 
522 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  32.26 
 
 
508 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  31.61 
 
 
920 aa  57.4  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.64 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  31.47 
 
 
563 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  28.67 
 
 
4881 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  26.18 
 
 
771 aa  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  34.09 
 
 
1804 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  28.8 
 
 
729 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  26.11 
 
 
1108 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  30.77 
 
 
563 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  33.07 
 
 
863 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  23.56 
 
 
901 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  43.66 
 
 
963 aa  47  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  43.21 
 
 
4909 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  28.47 
 
 
745 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1524  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.82 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0829839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  29.65 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  29.86 
 
 
563 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  24.8 
 
 
634 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  43.33 
 
 
1508 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>