100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00750 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  39.36 
 
 
264 aa  188  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.92 
 
 
268 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  31.65 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  31.76 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  31.76 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
262 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
271 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  31.93 
 
 
262 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  33.77 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
358 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  20.08 
 
 
244 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
298 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  28.03 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.92 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  27.45 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.45 
 
 
385 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.45 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.02 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  20.8 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.96 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  32.11 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.67 
 
 
345 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
294 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  22.04 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.46 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  24.1 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.74 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  21.79 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  21.4 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.94 
 
 
342 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  20.97 
 
 
218 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
276 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
279 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24 
 
 
397 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
336 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.94 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  32.89 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.75 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  22.71 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  25 
 
 
347 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  21.93 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  25.41 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  19.77 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>