96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00570 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  27.01 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  24.61 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  26.42 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  35.62 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  35.53 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  24.19 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.88 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  22.16 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  20.62 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  33.77 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1608  transcriptional regulator  20.21 
 
 		 176 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0667725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  39.34 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.79 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  22.49 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  42  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 179 aa  42  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 177 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 184 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 225 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>