More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00440 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
443 aa  921    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  76.43 
 
 
441 aa  697    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  63.62 
 
 
438 aa  570  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  54.07 
 
 
461 aa  495  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  56.98 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 
445 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 
445 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
445 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  39.67 
 
 
444 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 
445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.47 
 
 
421 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
435 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
443 aa  279  7e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  33.72 
 
 
424 aa  276  7e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  35.49 
 
 
454 aa  269  8e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  34.79 
 
 
454 aa  259  6e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  34.47 
 
 
448 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  34.23 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  31.36 
 
 
439 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  27.95 
 
 
428 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  26.9 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  25.46 
 
 
374 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.69 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.47 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
376 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.59 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.59 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.03 
 
 
375 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  25.72 
 
 
379 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  25.39 
 
 
382 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.33 
 
 
380 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.39 
 
 
466 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  25.26 
 
 
378 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.32 
 
 
389 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  25.88 
 
 
377 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.3 
 
 
372 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.35 
 
 
422 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
408 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  25.29 
 
 
377 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.57 
 
 
406 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  25.15 
 
 
376 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
412 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
381 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
461 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
443 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.04 
 
 
432 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.8 
 
 
388 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 
391 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  24.61 
 
 
379 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.94 
 
 
389 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.74 
 
 
379 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.07 
 
 
388 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.59 
 
 
375 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.25 
 
 
385 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  25.5 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0263  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.86 
 
 
379 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.46476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.71 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  24.02 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  25.47 
 
 
411 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  23.82 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.13 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.05 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  23.82 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  23.82 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  23.82 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.23 
 
 
403 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  23.83 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  23.56 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  23.56 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.8 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.65 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  32.58 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.54 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.28 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.82 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  24.46 
 
 
401 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.41 
 
 
384 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 
344 aa  93.6  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  23.3 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.65 
 
 
456 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.96 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.28 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  25.73 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0843  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.19 
 
 
394 aa  93.2  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199924  normal  0.0119015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>