22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00420 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.04 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.67 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0525  13S globulin  50 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  27.18 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  24.55 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  28.43 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  27.78 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  28.12 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.03 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>