More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00310 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  75.95 
 
 		 81 aa  130  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  69.62 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  66.23 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  65.75 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  65.75 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  57.33 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  61.04 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  58.9 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  56.76 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  58.11 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  56.94 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0095  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3004  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0878334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2892  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  0.381108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2890  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2821  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  51.22 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  53.33 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  54.17 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02147  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  54.17 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  56.94 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  52.7 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 201 aa  85.9  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>