129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  75.34 
 
 		 146 aa  232  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  34.27 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1260  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  24.66 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  24.66 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  30.61 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  26.71 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  33.07 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  25.85 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  25.85 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  32.28 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  32.28 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  30.69 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  31.18 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  28.43 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  21.23 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  24.58 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  24.58 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  28.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  28.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  31.18 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 270 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  28.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.61 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  23.33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 257 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  31.18 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  28.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 276 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  27.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  29.35 
 
 		 255 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.04 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  30.11 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  30.11 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  27 
 
 		 237 aa  50.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.58 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.5 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  28 
 
 		 238 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 238 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 254 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.14 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.17 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  28.71 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  30.61 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  29.9 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 245 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  30.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  29.59 
 
 		 238 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.69 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 236 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  25.74 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  32.67 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  27.55 
 
 		 247 aa  47  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.93 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  29.25 
 
 		 238 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  29.25 
 
 		 238 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  26 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.72 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  32.67 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  25 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  27.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  34.07 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  34.07 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  34.07 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.16 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 295 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>