11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00240 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  700    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  41.03 
 
 		 291 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  32.82 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  27.49 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  32.8 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  33.05 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  35.59 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  33.91 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  31.75 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  25.93 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>