91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00230 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  100 
 
 		 750 aa  1540    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  57.07 
 
 		 811 aa  243  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  48.44 
 
 		 592 aa  195  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  48.24 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  43.41 
 
 		 2495 aa  176  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  33.25 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  52.15 
 
 		 330 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  44.44 
 
 		 440 aa  167  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  42.94 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 651 aa  161  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  43.58 
 
 		 613 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  35.84 
 
 		 454 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  48.68 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  28.33 
 
 		 520 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 753 aa  147  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  28.15 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  28.15 
 
 		 520 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  28.17 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  40.13 
 
 		 807 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  27.96 
 
 		 520 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  39.13 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  39.89 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  39.64 
 
 		 532 aa  133  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  34.01 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  27.56 
 
 		 497 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  28.02 
 
 		 498 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  38.38 
 
 		 817 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  39.15 
 
 		 1557 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.67 
 
 		 302 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  38.2 
 
 		 377 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.72 
 
 		 891 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  25.83 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  26.71 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 342 aa  114  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 757 aa  111  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  32.78 
 
 		 434 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.54 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  35.53 
 
 		 331 aa  108  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.15 
 
 		 350 aa  105  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  35.14 
 
 		 1131 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.14 
 
 		 1131 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.29 
 
 		 1732 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  35.14 
 
 		 697 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  33.51 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  31.41 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  24.13 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  23.93 
 
 		 476 aa  98.2  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  39.46 
 
 		 465 aa  96.3  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  27.52 
 
 		 465 aa  94.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  24.67 
 
 		 458 aa  90.5  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  25.25 
 
 		 474 aa  89.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  24.42 
 
 		 473 aa  88.6  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  23.5 
 
 		 467 aa  87.8  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  24.55 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  50 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  28.04 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  22.98 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  42.86 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.56 
 
 		 762 aa  82.4  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  21.91 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  23.3 
 
 		 478 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  25.11 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  32 
 
 		 737 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 2821 aa  73.6  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  39.2 
 
 		 271 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.42 
 
 		 339 aa  72  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  23.51 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  22.89 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  30.95 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  23.18 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  27.6 
 
 		 1527 aa  65.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  30.18 
 
 		 890 aa  64.3  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  21.55 
 
 		 548 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  21.27 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  20.99 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  22.86 
 
 		 1514 aa  55.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  20.33 
 
 		 593 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25.27 
 
 		 1475 aa  53.9  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  25.75 
 
 		 589 aa  52.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  20.51 
 
 		 552 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  24.32 
 
 		 509 aa  51.6  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  26.24 
 
 		 605 aa  51.2  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.75 
 
 		 1363 aa  50.8  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  27.39 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.08 
 
 		 474 aa  47.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  27.22 
 
 		 587 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.66 
 
 		 399 aa  47.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 		 399 aa  45.8  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  35.37 
 
 		 630 aa  44.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>