More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 
313 aa  639  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  56.59 
 
 
308 aa  357  2e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  42.11 
 
 
326 aa  242  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  36.69 
 
 
381 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  39.02 
 
 
320 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.79 
 
 
306 aa  209  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.87 
 
 
332 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 
360 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  33.76 
 
 
342 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  35.46 
 
 
345 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  32.99 
 
 
348 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.59 
 
 
343 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.75 
 
 
363 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.76 
 
 
380 aa  173  3e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.55 
 
 
339 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
366 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  37.59 
 
 
323 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  36.92 
 
 
325 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 
339 aa  164  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  34.45 
 
 
320 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.62 
 
 
297 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 
330 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.14 
 
 
353 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  34.85 
 
 
371 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  32.63 
 
 
305 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 
350 aa  156  5e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.81 
 
 
386 aa  156  5e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  33.68 
 
 
323 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.06 
 
 
379 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
323 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  29.62 
 
 
358 aa  152  7e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.6 
 
 
336 aa  152  9e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.85 
 
 
336 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
351 aa  148  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
351 aa  147  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  31.23 
 
 
351 aa  147  2e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  31.23 
 
 
351 aa  147  2e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 
351 aa  147  2e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
351 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
351 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.23 
 
 
351 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  29.33 
 
 
361 aa  146  4e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.34 
 
 
351 aa  145  8e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 
350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 
350 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.48 
 
 
317 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 
350 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 
350 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.2 
 
 
350 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 
328 aa  140  2e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 
341 aa  140  2e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 
351 aa  141  2e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  31.75 
 
 
323 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 
336 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.65 
 
 
336 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.9 
 
 
348 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 
337 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.54 
 
 
348 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
321 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  32.41 
 
 
325 aa  136  6e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  29.64 
 
 
312 aa  135  7e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 
344 aa  135  7e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 
339 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  32.79 
 
 
338 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 
346 aa  135  1e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 
333 aa  134  1e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 
309 aa  135  1e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.26 
 
 
343 aa  134  2e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.88 
 
 
343 aa  134  2e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.86 
 
 
351 aa  133  4e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.81 
 
 
335 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  34.75 
 
 
340 aa  132  8e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 
338 aa  132  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.21 
 
 
367 aa  131  1e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 
348 aa  132  1e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 
345 aa  130  2e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 
335 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 
344 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.88784e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 
338 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 
349 aa  129  8e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  27.59 
 
 
359 aa  129  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.59 
 
 
331 aa  128  1e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  3.84441e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  27.59 
 
 
345 aa  128  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  29.61 
 
 
315 aa  127  2e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  34.07 
 
 
308 aa  126  4e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 
349 aa  126  4e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 
335 aa  126  4e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  31.94 
 
 
316 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.15 
 
 
349 aa  126  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.63 
 
 
349 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
340 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.48 
 
 
361 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 
343 aa  125  8e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.26 
 
 
353 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.12 
 
 
379 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  31.28 
 
 
337 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.76 
 
 
343 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.1 
 
 
305 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.52 
 
 
342 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>